藏族胃癌患者术后复发相关微小RNA筛选及其生物信息学分析

林明哲；杨桢；李欣；郭海州；李晓琴；姬发祥；赵久达

关键词：胃癌, 复发, 微小RNA, 生物信息学, 藏族

摘要：目的筛选藏族胃癌患者术后复发相关的微小RNA(miRNA),并分析其靶基因及其功能.方法选取术后复发与未复发藏族胃癌患者各10例,收集其外周血标本,采用高通量测序方法获得miRNA的表达谱,利用Limma软件分析两组标本中差异表达的miRNA,预测其调控的靶基因并构建调控网络,并对靶基因进行生物学通路富集分析.结果共23个miRNA在复发与非复发两组标本中存在差异表达,其中9个miRNA上调表达、14个miRNA下调表达.共预测获得20个miRNA的922个靶基因;构建的调控网络中,调控下游靶基因数量多的miRNA包括hsa-miR-21-5p、hsa-miR-93-5p及hsa-miR-196a-5p.miRNA靶基因参与的生物学通路包括DNA复制、细胞周期、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等.结论多个miRNA在藏族胃癌患者术后复发中发挥作用,或可作为相关的分子标志物以评估患者预后.